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2001 erschien für Nintendos Game Boy Color ein Ableger der Serie unter dem Titel MGS: Ghost Babel. Um den Wiedererkennungswert zu nutzen, wurde die deutsche Version unter der Bezeichnung Metal Gear Solid veröffentlicht.

Auch an der Entwicklung dieses Spiels war Hideo Kojima nicht beteiligt. Inhaltlich gab es keine Verbindungen zur PlayStation-Version. Auch wird Ghost Babel nicht als direkte Fortsetzung der Serie gewertet.